FASTA-FORMAT

  In der ersten Zeile einer Datei steht hinter einem ">" ein Bezeichner für eine Sequenz, in den weiteren Zeilen folgt die Sequenz selbst. Leerzeilen werden überlesen.

Beispiel:

>gi|139617|sp|P09184|VSR_ECOLI PATCH REPAIR PROTEIN
MADVHDKATRSKNMRAIATRDTAIEKRLASLLTGQGLAFRVQDASLPGRPDFVVDEYRCVIFTHGCFWHH
HHCYLFKVPATRTEFWLEKIGKNVERDRRDISRLQELGWRVLIVWECALRGREKLTDEALTERLEEWICG
EGASAQIDTQGIHLLA

Multiples-FASTA-Format

  Eine Datei kann mehrere Sequenzen enthalten, die dann als Folge von FASTA-Einträgen anzulegen sind. Das FASTA-Format ist oben beschrieben.

Beispiel:

>SEQUENZ1
ACTCFTGCGCGCGC.....
>SEQUENZ2
ACGCGCGCTCFTGCGCGCGC.....
>SEQUENZ3
GTTGGGACTCFTGCGCGCGC.....
>SEQUENZ1
TGCGCACTCFTGCGCGCGC.....